9.高精度なタンパク質-リガンド相互作用解析に向けて 1)フラグメント分子軌道法によるタンパク質-リガンド複合体の相互作用解析とアフィニティ計算

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【この商品は紙の出版物を、記事単位・論文単位に分割して、電子書籍として配信しています。】フラグメント分子軌道(FMO)法は,タンパク質などの巨大分子全体を量子化学計算できる方法である。この方法によるとタンパク質とリガンドの結合エネルギー計算に加えてリガンドとの相互作用をアミノ酸残基単位で詳細に解析できるため,ドラッグデザインにおいて有用な知見を与える。また,リガンドのタンパク質へのアフィニティ(結合自由エネルギー)を求めるには溶媒効果を考慮することが不可欠であるが,定量的な計算結果を得るためには溶媒モデルの精密化など,今後,解決すべき課題が残されている。

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