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4.遺伝子セットを使った発現情報の解析(GSEA解析)

【この商品は紙の出版物を、記事単位・論文単位に分割して、電子書籍として配信しています。】DNAマイクロアレイの実験結果を解析する場合、コントロール群との比較である程度の発現変動を示す遺伝子を抽出すると、膨大な遺伝子のリストになり、生物学的な意味を捉えることが困難になる。遺伝子セットを使った解析では、こういった問題を解決できる可能性がある。特にGSEAは従来の遺伝子セットを使った解析と計算方法が違うことに加え、MSigDBという独自の遺伝子セット情報を内包している。これには、既報のマイクロアレイを使った研究から、様々な実験条件で発現変動した遺伝子セットが収められており、こうした情報とともに解析す (...)

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